Algunas diferencias con Julio Baldivieso dieron lugar a esta situación. "Algunas diferencias de pensamiento con Julio que se quedan en la intimidad. Soy muy respetuoso de los códigos", mencionó Carlos Borja.
El Capitán histórico de la verde se va conforme por la labor desempeñada en el tiempo que acompañó al emperador "Iniciamos un cambio importante en la selección" dijo, destacando que la medida "Es una decisión de Julio, no hubo explicación del porqué, pero así como no pedí explicación cuando me invitó no espero una ahora".
Carlos Borja llegó al cuerpo técnico de la verde el 31 de agosto, cuando recibió la invitación de Julio Baldivieso.
Estuvo presente en 5 partidos con la selección en 2015, contra Argentina en EE.UU. y por eliminatorias contra Uruguay, Ecuador, Venezuela y Paraguay.
